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北京协和医院建成于1921年，是北京协和医学院的附属医院。新中国成立后，人民政府于1951年接管北京协和医院。1971年，医院曾改名为首都医院，1985年恢复北京协和医院名称。党和政府十分关心这所医院的成长，多次接见医院的专家和领导，对医院的建设、知识分子工作都曾做过重要指示。由国务院批准的北京协和医院扩建工程于1995年投入使用，成为医院发展中的一个新的里程碑。
现在，北京协和医院是中国协和医科大学的临床医学院，中国医学科学院的临床医学研究所，集医疗、教学科研为一体的综合性医院，是国家卫生部指定的全国疑难病症技术指导中心之一。1991年通过了三级甲等医院的评审，1992年被评为全国卫生系统先进集体。
目前，医院占地面积8万平方米，在岗工作职工2300余人，正副教授和相应职称的人员301人，其中在中华医学会及其分会和国家级杂志担任职务者128人。目前床位使用总数900张，日门诊量超过3000人次，年住院人数13000余人次，同时还承担着大量外宾和高干的医疗保健任务。
医院承担八年制协和医科大学的临床教学任务。现有博士后流动站5个，博士点11个，有博士生导师55名，硕士生导师104名。每年接收全国各地来院进修医师、护士和其它进修人员300余名，并接收部分外国留学生。医院设有自己的护士学校，目前在校生达280人。
医院每年承担国家级、省部级等科研项目100余项，平均每年在国家级和国外杂志发表论文400余篇，十几年来获国家级科技进步奖15项，其中一等奖二项，部级奖62项，医科院级奖77项。
医院与世界各国的学术交流频繁，已成立了七个中外合作中心，促进了医院现代化建设和医教研工作的开展。
