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卫生部中日友好医院是由日本国政府提供无偿援助，中日两国政府合作建设的大型综合性现代化医院。1984年10月23日开院，直属中华人民共和国卫生部领导。医院位于北京市朝阳区和平里樱花东路，占地10.5公顷，目前建筑面积十余万平方米，开设床位1315张，设有53个临床、医技科室，并附设中日友好临床医学研究所及培训中心。医院以疑难病、危急重症诊治为重点，以中西医结合为特色，融医疗、教学、科研、康复和预防保健等多项功能为一体，同时承担国家干部保健任务以及100多个国家、地区的涉外医疗任务。
卫生部中日友好医院于1993年被评为国家三级甲等医院, 并先后被评为北京市“十佳”医院和全国“百佳”医院。2001年被列为中央保健医院。同时是北京大学医学部中日友好临床医学院和北京中医药大学临床医学院。医院拥有一大批国内外知名专家、学者和优秀的中青年医务工作者，现有副高级职称以上人员400余人，硕士研究生学历以上人员近400人。拥有螺旋扫描CT机、磁共振成像系统、单电子发射计算机断层仪、血管造影X线机、医用直线加速器、彩色多普勒超声诊断仪、手术导航装置、全自动生化分析仪等性能先进的大型医疗设备。
卫生部中日友好医院始终坚持“科教兴院”、“人才强院”的发展战略，已逐步形成了自己的特色和优势。建院以来，医院承担了多项国家级、省部级科研课题，曾获国家级、省部级科技进步奖等多项奖项，并先后培养了500多名博士研究生和硕士研究生。医院的肾内科、神经内科、心内科、骨科、中医肿瘤科是国家卫生部临床学科重点项目；骨科还是首都医学发展基金重点项目，中医肿瘤科还是国家中医药管理局重点学科；电化疗科、中医肛肠科是国家卫生部十年百项计划项目；中医风湿病科、电化疗科、检验科是首都医学发展基金重点项目。
建院以来，卫生部中日友好医院作为全国医疗行业对外交流的窗口，与日本、美国、韩国、欧洲等许多国家的大学、科研单位和医疗机构等建立了良好的合作关系。医院与日本东京大学、日本大学、日本大阪医科大学、日本国立富山药科医科大学、美国华盛顿大学、芬兰赫尔辛基理工大学等有着密切的学术交流和科研协作关系，医院聘请了国外82位医学及管理专家作为医院的名誉教授，同时医院有近20位管理专家和医学教授被聘为国外知名大学的名誉教授和客座教授，并先后成功举办了60余次国际学术会议。
卫生部中日友好医院连续8年获“首都精神文明单位标兵”和“中央国家机关精神文明单位标兵”光荣称号, 并曾被外国人在京协会评为“外国人在京就医国有医院满意率第一单位”。2003年，我院被定为全国保持共产党员先进性教育活动试点单位之一，同年，在抗击非典斗争中被定为临时SARS定点医院，在卫生部党组的直接领导和全院职工的共同努力下，出色地完成了任务。
