深圳市南山区人民医院感染科成立于1993年，是深圳西部最大的感染性疾病诊治中心，肩负着南山区及周边地区传染病医疗、教学、科研、预防和保健指导等任务，负责南山区各医院感染性疾病会诊及诊治指导工作。拥有病床40张，收治各种传染病及复杂感染性疾病，年出院病人2000余人；开设有发热、肠道、肝炎专科及手足口病门诊，日门诊量约200人次。自2003年以来，科室大胆创新，在临床、科研和教学三方面均大踏步向前发展，先后开展了多项新技术、新项目，对各型病毒性肝炎、肝硬化及各种原因引起的肝损害（酒精性、药物性、血吸虫、肝吸虫等）的诊断治疗，乙肝、丙肝抗病毒治疗，尤其是重型肝炎的早期治疗等方面积累了丰富的临床经验；对重型肝炎的抢救成功率达60%以上，达到了国内先进水平。在发热待查、黄疸待查、皮疹待查及各类难治性感染等疑难杂症的诊断及治疗方面积累了丰富的临床经验。目前正在进行微生物生境、细菌耐药基因、基因工程菌改造及常见传染临床路径实施等研究。在多次突发公共卫生事件及重大传染病的防控中发挥了桥头堡的作用。2003年SARS肆掠华夏时，科室坚定地接受了政府交给的甄别及防治SARS的任务，全科上下，众志成城，以优良的医疗技术水平、高尚的医德医风和无畏的精神气概顺利完成了防治SARS的重任，用实际行动诠释了白衣天使的神圣职责。科室因此荣获广东省抗击非典先进集体，南山区抗击非典模范集体，邓启文主任荣立广东省抗击非典二等功，深圳市抗击非典二等功，南山区抗击非典一等奖。2009年6月，感染科被市卫人委指定为深圳市甲型H1N1流感筛查定点科室，在卫生部防控甲型H1N1流感的督导检查中获得好评。2009年被评为深圳市南山区重点学科，目前整体水平已经符合三级甲等医院感染科的诊疗要求，诊疗技术已达到三甲医院重点专科水平。如今的感染科，犹如插上了腾飞的翅膀，本着“以病人为中心，用科学的态度，精湛的医术和高尚的医德为患者提供优质的服务”的宗旨，全体医护人员齐心协力、勇于开拓、锐意进取，全面提高服务质量及科研技术水平，全力以赴迎接新的挑战。科室构架及人员组成深圳市南山区人民医院感染科目前拥有临床医生15人，其中博士2人，硕士4人；高级职称3人，中、初级职称12人。