黑龙江省中医院是一所集科研、医疗和研究生教育于一体的综合性中医药科研医疗机构。现有职工561人，编制床位450张，拥有国家级重点专科3个，国家三级实验室2个，省政府重点学科6个，省中医重点专科8个，共获得科技成果200多项，其中获部省级科技进步奖60多项，现承担部省级以上科技攻关课题50多项，硕士学位授予权5个和博士后科研工作站1个。
　　黑龙江省中医院作为一所综合性中医院，在科室设置上体现了“大专科、小综合”的特点，强调中医专科(专病)的医疗发展方向。目前设中医特色的一级科室有内、外、妇、儿、骨、针灸、按摩等8个，肾病、心病、脾胃病等二级专业分科12个，糖尿病、中风、风湿、结石等专病诊室14个，设医技科室10个。拥有国家级重点专科3个，国家三级实验室2个，省政府重点学科6个，省中医重点专科8个。二级专病治疗中突出“能中不西，先中后西”的特点，尽量发挥中医药治病求本、副作用小和价格低廉的优势。在这些中医专科中，以中医肾病、心血管病、针灸等中医特色最为突出，疗效最为稳定。中医肾病科是全国中医肾病重点专科，该科拥有一批造诣较深又颇有影响的肾病专家，形成了老中青结构合理的医疗、科研、教学队伍，该科室探索出多种能够突出中医特色又有别于常规方法的诊疗手段，其中首创“祛邪扶正兼顾，以祛邪为主”的治疗原则治疗慢性肾小球肾炎和肾病综合症，取得了极大的成功。该科还拥有全省最先进的血液透析中心。中医心血管病专科作为国家中医药管理局“十五”重点专科项目建设单位，在长期的临床医疗实践中积累了丰富的经验，并不断借鉴国内外先进科学技术和手段，对中医药治疗各种心脏病，特别是冠心病、心肌梗塞、心律失常等进行了系统深入地研究，并形成了一套完整的科学理论体系和治疗手段。针灸（神经内）科是省政府重点学科，该科打破了以往治疗中风的传统模式，形成了以“卒中单元”为主，针灸、中西药与现代康复相结合的一套完整的治疗中风的体系；在治疗效果上又有了新的突破，并积累了丰富的临床经验，形成了我省规模最大、床位数最多、康复环境最好、治疗效果最佳的中风病诊疗体系。为了健全作为综合性医院的功能，另设立了普外科、急诊科和口腔科。