九三中心医院是一所与共和国同龄，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的二级甲等综合性医院。经过五十多年几代九三医院人的无私奉献，艰苦奋斗，开拓创新，医院已由当初几个人的小卫生所，逐渐发展壮大成为学科门类齐全、医疗装备精良、专科特色鲜明、技术水平不断提高、后勤保障有力，为九三垦区系统内外几十万人民群众提供高水平医疗保健服务的区域性医疗服务中心和龙头医院。
九三中心医院占地4万平方米，医疗业务用房2万平方米，绿化面积2.3万平方米，编制床位252张；全院在职员工390人，其中技术人员344人，具有中级以上技术职称人员196人。
九三中心医院主要医疗装备有核磁共振、螺旋CT、数字化彩超、大型影像增强X光机、西门子大型悬吊式X线摄影床、C臂X线数字减影系统、动态心电、运动心电复合分析系统、心脏频谱、经颅多普勒、肌电诱发电位、脑电地形图、各种腔镜、大生化等全自动检验设备、多参数监护设备、体外震波碎石机、人工肾、高压氧舱、多功能麻醉机等设备116台件。
九三中心医院随着时代的发展和人才战略的实施，已经形成了本地区技术先进的神经内科、心血管内科、骨外科、普外科、流行性出血热治疗、血液净化、血液稀释平衡疗法、溶石、排石、碎石等独具特色的重点专业学科。除完成所有“二甲”医院应开展的业务外，许多科室已能够独立完成一些“三甲”医院应开展的技术项目。先后有33项科研课题分别获省、总局、分局科研成果一、二、三等奖，其中省级2项，总局级22项，分局级9项；有69项新技术分别获院内新技术推广应用一、二、三等奖；引进开展新技术、新项目百余项，并有多项新技术填补了医院空白；医务人员每年发表在国家级、省级杂志和各种学术会议上的论文近百篇。
九三中心医院为加强医院与外界的技术与信息交流，医院与哈尔滨医科大学附属第一医院、第四医院、中国人民解放军211医院和齐齐哈尔第一医院建立了协作关系。INTERNET网络的远程会诊系统、计算机管理系统已在院内得到广泛的开发应用，搭建了医院管理科学化、数字化、信息化和现代化的平台。为提高医院的管理质量，全面提升医院的社会公众信誉和形象，自2001年6月起医院导入实施了ISO9001：2000国际质量管理体系，并成为全省同行业中第二家通过国际质量管理体系认证的医院。
九三中心医院除承担本系统职工基本医疗保险服务任务外，并已成为嫩江县城镇职工基本医疗的定点医院、嫩江县“新农合”定点医院和讷河市农村合作医疗的定点医院。