南通市肿瘤医院始建于1972年。是国内创建最早、规模最大的地市级肿瘤专科医院。现有职工数和床位数超过全国多数省级肿瘤医院。全院1000余名职工中。有专业技术人员700余名。其中高级专业技术人员164名。中级专业技术人员421名。

南通市肿瘤医院集医、教、研于一体。系南通大学附属肿瘤医院、南通市第五人民医院、苏州大学教学医院、南京医科大学教学医院。也是卫生部认定的“全国百万妇女乳腺病普查工程”定点医院之一。医院由南院和北院两个部分组成。北院位于通州市平潮镇。开放床位700张。年住院病人10000余人次；南院位于南通市中心。其前身南通港口医院是一所二级综合医院。现开放床位200张。院内附设有南通市肿瘤研究所、南通市肿瘤放疗中心、南通市肿瘤化疗中心、南通市病理诊断中心。病理科为南通市医学重点学科。内科、妇科、放疗科为南通市临床重点科室。肝胆肿瘤科为南通市临床重点建设专科。麻醉科为徐州医学院麻醉学硕士研究生培训点。

南通市肿瘤医院全面拥有手术、放疗、化疗（含介入治疗）、生物治疗、中西医结合治疗等综合治疗手段。拥有国内一流的洁净手术室、百级层流病房。拥有各类肿瘤诊疗设备1300余台（套）。如X-刀、伽玛刀、直线加速器、东芝模拟机、螺旋CT、ECT、核磁共振、超声波碎石机、卫生部配备的肿瘤专用健康体检车等。对各种肿瘤的诊治在省内处于领先水平。在国内具有一定的影响。全国有25个省（市）的肿瘤患者慕名前来就诊。建院30余年来。先后已有300多万名患者来院就诊。收治各类肿瘤病人30余万人次。