淮安中医院肛肠病诊疗中心创建于1983年，经过多年的建设，不断发展壮大，在市内肛肠病诊疗方面一直处于领先地位。2001年经市卫生局批准，在市中医院挂牌成立淮安市肛肠病诊疗中心。中心长期与南京市中医院、全国肛肠病诊疗中心合作，拥有专家、主任多名，多人担任淮安市中西医结合学会和中医药学会肛肠病专业委员会正副主任委员、秘书长等职。随着技术水平的进步，服务质量的提高，综合实力不断增强，现已成为一个设施齐全、技术力量雄厚、服务质量一流，集医疗、教学、科研于一体的市级肛肠病诊疗中心。淮安中医院肛肠病诊疗中心配有彩色腔内B超、显微乙状结肠镜、电子结肠镜、肛肠中药熏蒸治疗机、肛门疾病综合治疗仪、灌肠仪等一系列先进诊疗设备。中心十分注重科研与临床相结合，积极引进国内外新技术、新项目，始终保持技术上的领先。率先在市内开展“PPH手术”、“排粪造影”、“直肠腔内超声”、“结肠运输试验”等国内外诊治肛肠疾病先进技术，并运用西医手术、中医辨证换药等中西医结合方法治疗直肠癌、结肠癌、肠息肉、内外痔、肛门脓肿、肛瘘等疾病，疗效显著。