宝安中医院肛肠科于1990年医院建院时就已开设。经过近20年的奋斗，已成为具有浓郁中医特色的痔瘘专科。肛肠科现拥有4人，其中副主任医师1人，主治医师2人，护理治疗师1人。通过近20年的建设和发展，目前已开展各类痔疮、肛瘘、肛裂、息肉、肛周脓肿、肛窦炎、肛乳头炎、肛门湿疹、瘙痒症、结、直肠炎、便秘等系列大肠、肛门疾病方面疾病的治疗。特别对肛门、直肠类疾病的治疗取得了较好的疗效。本科发挥中医药特色，研制出一系列具有独特疗效的内服、外洗、外敷膏、丹、丸、散等十余种中药制剂。目前有省市级科研成果一项，有一项区级科研成果登记。