吉林大学中日联谊医院心外科是吉林省最大的心血管外科诊疗中心。其服务的专业范围为所有心脏病患者，包括冠心病、风湿性心脏瓣膜病、先天性心脏病、心脏肿瘤、心肌病、心脏外伤、各种重症晚期心脏病及主动脉瘤和主动脉夹层动脉瘤。吉林大学中日联谊医院心外科，即吉林省心血管病研究所，是吉林省心血管病医疗、科研、预防和人才培养的重要基地。1952年开展了缩窄性心包炎的部分心包切除手术；动脉导管未闭的动脉导管闭合术；1956年相继进行了首例风心病二尖瓣狭窄的闭式二尖瓣分离术。经过了50多年的发展历程，吉林大学中日联谊医院心外科迄今共完成各类心脏、大血管手术8000余例。心血管外科诊疗中心现有床位30张，配有一个10张床位的现代化监护室。周手术量10余台，年手术量350例以上，是吉林省最大的心血管外科诊疗中心。目前有医师和护士共23人，其中教授1人，副教授4人；具有博士学历2人，硕士7人，形成了老中青相结合的实力雄厚的技术队伍。目前对于复杂先心病、冠心病、风湿性心脏瓣膜病、心脏移植，从术前诊断、外科手术到术后处理我科都居省内领先水平，一些复杂先心病、风湿性心脏瓣膜病的诊治水平达到国内先进水平。目前，风湿性心脏瓣膜病的手术成功率98.5%以上，冠脉架桥手术成功率98%以上，简单先天性心脏畸形的手术成功率99.8%以上，并发症少，达到国内先进水平；法洛氏四联症、法洛氏三联症等，手术成功率为99%以上。婴幼儿先心病手术比例和成功率均逐年提高。小体重及婴幼儿手术数量逐年增加。我心血管外科诊疗中心技术力量雄厚。吉林省胸心血管外科学会副主任委员张秀和教授任首席专家，亲自指导并参与中心的医教研工作。张柏民、姜亦忠副教授参与中心的医教研工作。我心血管外科诊疗中心有4名研究生导师，拥有心脏瓣膜及辅助循环研究室。在心脏移植，人工心脏瓣膜等方面开展着省内领先的研究工作。