儿科医院心血管中心是在著名小儿心内外科专家宁寿葆、张善通教授创导下建立的国内最早的小儿心血管内外科融为一体的特色科室。经过十余年的学科建设，已经成为国内驰名的小儿心脏中心。承担教育部、卫生部、上海市重大科研项目8项，每年施行心导管造影介入200余例、超声心动图检测5800余例、动态心电图和运动平板试验800余例。每年在各类国内外专业杂志发表论文40余篇，共编写专著20余篇。曾获国家级、省部级科技进步二、三等奖9项。另外，每年都要承办“全国先天性心脏病诊断治疗学习班”。心内科专业已有四十余年历史，在心血管疾病的诊治方面积累了丰富的经验。五十年代中期，在国内首先开展心导管检查和心血管造影，八十年代初，在国内较早开展彩色多普勒超声诊断心血管疾病的工作，大大提高了先天性心脏病和其他心血管疾病的诊断水平。对病毒性心肌炎、风湿热、川畸病，心肌病、各类心率失常等心血管疾病的诊治在国内享有较高知名度。学科带头人儿科医院院长桂永浩教授现任为中华医学会儿科学会副主任委员、心血管专业组组长、上海儿科心血管专业组组长。心内科在心血管疾病的诊治方面每年诊治各类心血管疾病约2500例次，拥有多位国内著名专家，在复杂性先心病、病毒性心肌炎、风湿热、川畸病、心肌病、心律失常等心血管疾病的诊治上享有较高知名度。我院的心胸外科业务发展亦非常迅速，至今累计施行先心病外科手术4800余例，年手术由最初的数十例增加至目前的近400例，对于常见先心病手术成功率已高达98％，婴幼儿先心病的手术死亡率降至5.5％，婴幼儿法四手术死亡率低于3％，小于1岁的婴幼儿手术比例高达50％，在复杂先心病如单心室、大动脉转位、右室双出口、完全性房室间隔缺损的手术治疗方面已能成功开展Switch手术，具备纠治各类复杂畸形的技术能力。体外循环技术方面已开展包括改良超滤在内的多项新技术，而在心肌保护技术方面也开展了包括含血心肌保护技术在内的多项新技术，使手术效果大大改善。2000年购进的胸腔镜使我院能率先开展小儿胸腔镜检查及治疗技术。