仁济医院为了更好地进行肿瘤的专业性综合治疗，于2004年2月成立了肿瘤科。仁济医院肿瘤科现有主任医师（教授）1名、主治医生2名、住院医生2名，其中具有博士学位2名、硕士学位3名，另有在读博士研究生3名、硕士研究生4名。现任科主任及学科带头人张凤春教授为中国抗癌协会理事、中国抗癌协会临床肿瘤协作中心执行委员、上海市癌症康复和姑息治疗专业委员会委员、上海第二医科大学肿瘤中心委员、国家自然科学基金评审专家。临床工作方面，2004年2月初在东西两院开设肿瘤专家门诊，2004年4月开设东西两院肿瘤专科门诊。2004年，月在仁济西院成立了专科病房，暂时设有床位16张，另在两家协作医院（长航医院及杨思医院）拥有床位约40张。在2005年4月浦东仁济医院外科大楼投入使用后，肿瘤科将拥有一个具有40多张床位的病区。仁济医院肿瘤科诊治范围包括：乳腺癌、肺癌、消化道肿瘤、泌尿系肿瘤、脑肿瘤、妇科肿瘤、恶性胸腹水及各种转移癌等实体瘤。根据肿瘤的病理类型、临床分期、肿瘤细胞的基因和分子信号、机体状况及术前术后等多种因素对病人进行化疗、热化疗、免疫治疗、生物治疗、靶向治疗、微创治疗、逆转肿瘤耐药等个体化综合治疗。同时，仁济医院肿瘤科正在开展数项特色医疗项目，如采用内生场热疗仪进行热疗、热化疗、胸腹腔热灌注化疗等治疗人体深部肿瘤及恶性胸腹水；采用微创技术进行肿瘤微创介入靶向治疗和先进的生物靶向治疗。此外，科室在恶性肿瘤微转移灶检测和清除方面处于国内前沿地位。