南方医科大学中西医结合医院脑病科是国家教育部、广东省教育厅中西医结合临床重点学科的主干组成之一，中西医结合医学一级学科博士、硕士学位授权点的主干学科之一，国家中医药管理局中医脑病重点学科的建设单位，也是国家中医药管理局中医脑病重点专科的建设单位，承担中医药治疗偏头痛的临床验证工作，是广东省中西医结合疼痛专业委员会的主委单位。
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